Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 KRT8P51-201ENST00000438938 274 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RN7SL39P-201ENST00000462264 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RN7SKP288-201ENST00000516227 268 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 RNU6-567P-201ENST00000516746 107 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AP000873.2-207ENST00000529607 452 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 TEX26-AS1-204ENST00000585582 853 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 CDKL5-205ENST00000623535 12533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 VPS50-220ENST00000544910 5736 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
LAPTM4AQ15012 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.59□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TRIM64B-201ENST00000329862 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 DZIP3-202ENST00000463306 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LGALS8-220ENST00000526634 1852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NAT1-203ENST00000517492 2280 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC232271.1-201ENST00000602455 2715 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 CEP85L-201ENST00000360290 1736 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 RNA5SP346-201ENST00000363541 121 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 ST3GAL3-212ENST00000372362 468 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RPS23P10-201ENST00000416185 486 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC093151.2-201ENST00000429109 394 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 AL445991.1-201ENST00000450381 475 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 HMGN1P26-201ENST00000558737 303 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TCF4-268ENST00000629387 3789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 TDRD5-202ENST00000367614 3632 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
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LAPTM4AQ15012 CHRDL1-202ENST00000372045 3860 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 PUS10-201ENST00000316752 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 TBC1D15-201ENST00000319106 2159 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL121594.3-201ENST00000557565 3857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 STK33-208ENST00000447869 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ERVH48-1-201ENST00000447535 2790 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SLAMF6-202ENST00000368057 2712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 MTO1-212ENST00000498286 10857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ARID4A-203ENST00000395168 4051 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 AL591135.1-201ENST00000401578 5914 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 NDRG3-202ENST00000359675 2917 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 RNA5SP77-201ENST00000365394 120 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
LAPTM4AQ15012 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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