Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 TAS2R20-201ENST00000538986 1381 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC073264.1-201ENST00000411508 416 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC034244.1-201ENST00000507687 207 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SHPRHQ149N8 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MDM2-203ENST00000299252 966 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 TRAPPC2P5-201ENST00000426293 308 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RAB9AP5-201ENST00000437794 597 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
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SHPRHQ149N8 AC106791.1-201ENST00000514616 827 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 PPFIA2-AS1-202ENST00000549161 1080 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 SNHG22-203ENST00000617833 660 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 CASP3P1-201ENST00000446037 609 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SHPRHQ149N8 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
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