Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC008897.1-201ENST00000494006 347 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 HMGB2P1-201ENST00000591146 634 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 PIK3C3-201ENST00000262039 9443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LRRC77P-206ENST00000481578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 BX510359.2-201ENST00000417920 305 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RPL23AP43-201ENST00000446445 471 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 ZNF273-204ENST00000476120 2000 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RN7SL481P-201ENST00000477764 299 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC024958.1-203ENST00000520256 577 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC090809.1-201ENST00000524132 570 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 TRAV30-201ENST00000557168 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
SSPNQ14714 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.59□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SSPNQ14714 AC016397.1-201ENST00000412463 242 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
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