Protein–RNA interactions for Protein: Q14108

SCARB2, Lysosome membrane protein 2, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2Q14108 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RNA5SP31-201ENST00000411144 127 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC126124.2-201ENST00000413542 321 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC093578.1-201ENST00000415219 368 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC091917.1-201ENST00000506330 566 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SUB1-211ENST00000512913 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC087276.4-201ENST00000530042 444 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MIR544B-201ENST00000582372 78 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
SCARB2Q14108 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 CD2-201ENST00000369477 478 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010468.1-201ENST00000461022 817 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 PDCD10-206ENST00000470131 1026 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 TRAV37-201ENST00000553906 342 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL450442.1-201ENST00000554042 854 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC239868.4-201ENST00000608318 671 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC004975.1-201ENST00000428733 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
SCARB2Q14108 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
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