Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC100807.1-201ENST00000517640 552 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC079598.1-201ENST00000548691 554 ntTSL 4 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 GYPA-212ENST00000616983 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DYRK1A-202ENST00000339659 8654 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.52□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TES-202ENST00000393481 2763 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNMT-202ENST00000383314 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC140479.3-201ENST00000418944 1126 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC005086.4-201ENST00000623065 213 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 DICER1-202ENST00000393063 10220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.51□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 ZNF33A-202ENST00000374618 6122 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 GAPT-201ENST00000318469 2119 ntAPPRIS P1 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC138965.1-202ENST00000502354 547 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC140125.3-201ENST00000505248 547 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC063949.1-201ENST00000552900 865 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC091073.1-201ENST00000559620 666 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 MMRN1-202ENST00000394980 5217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 AC107081.3-201ENST00000612715 2034 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
COL9A3Q14050 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
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