Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 NDUFA5P7-201ENST00000452914 242 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 LINC00535-204ENST00000520513 305 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
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PDE6HQ13956 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
PDE6HQ13956 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
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PDE6HQ13956 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 ANKRD36P1-201ENST00000344424 659 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU1-73P-201ENST00000383971 164 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
PDE6HQ13956 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
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