Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC093297.2-207ENST00000505401 692 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 SNORD84-203ENST00000584275 78 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL133370.2-201ENST00000619934 439 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
CACNA1CQ13936 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC1.53□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SNORD59.2-201ENST00000516873 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC010809.3-201ENST00000621310 641 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC091534.1-201ENST00000548779 1751 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 ZNF33BP1-201ENST00000452497 1834 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 EEF1E1-201ENST00000379715 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 TPMTP4-201ENST00000450749 678 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL163540.1-201ENST00000485382 386 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 OR5AQ1P-201ENST00000527596 927 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MLIP-AS1-201ENST00000434196 1534 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC000111.1-201ENST00000441019 221 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
CACNA1CQ13936 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
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