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| RUNX3 | Q13761 | C7orf66-201 | ENST00000624695 | 435 nt | TSL 2 BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC092192.1-201 | ENST00000633154 | 1018 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYP3A51P-201 | ENST00000633513 | 256 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | USP15-203 | ENST00000353364 | 14950 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ADGRG4-203 | ENST00000394143 | 9931 nt | APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF734P-201 | ENST00000419494 | 1534 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.92 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC096644.4-201 | ENST00000563417 | 2912 nt | BASIC | 3.03 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | RPL21P40-201 | ENST00000428586 | 483 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC093639.1-201 | ENST00000441026 | 473 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC016751.2-201 | ENST00000453206 | 280 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
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| RUNX3 | Q13761 | AC027335.1-201 | ENST00000515377 | 543 nt | TSL 4 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU4-60P-201 | ENST00000517239 | 135 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TRIQK-209 | ENST00000519969 | 555 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103783.1-201 | ENST00000520506 | 373 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC103952.1-201 | ENST00000521872 | 590 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP001189.6-201 | ENST00000528781 | 831 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAPK1-204 | ENST00000544786 | 951 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC005225.1-201 | ENST00000553394 | 937 nt | TSL 3 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC007495.1-203 | ENST00000569025 | 888 nt | TSL 5 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MIR4319-201 | ENST00000577285 | 85 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC138761.3-201 | ENST00000579993 | 334 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC091691.2-201 | ENST00000581940 | 567 nt | TSL 4 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | WISP1-OT1-201 | ENST00000602893 | 642 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL009028.1-201 | ENST00000604895 | 802 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ATP1B3P1-201 | ENST00000605365 | 821 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC122133.1-201 | ENST00000613964 | 233 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL031667.3-201 | ENST00000620124 | 655 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006065.5-201 | ENST00000623427 | 349 nt | BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CPD-202 | ENST00000543464 | 4007 nt | TSL 2 BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | STEAP4-201 | ENST00000301959 | 2321 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | NEDD4-208 | ENST00000508342 | 7235 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.02 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PRRG1-202 | ENST00000449135 | 4481 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | IL2-201 | ENST00000226730 | 1029 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | OR6C75-201 | ENST00000343399 | 939 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-500P-201 | ENST00000362349 | 107 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-660P-201 | ENST00000364566 | 109 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RNU6-356P-201 | ENST00000384140 | 107 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4LP20-201 | ENST00000402379 | 270 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | PSMA4-202 | ENST00000413382 | 1019 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | RPL30P2-201 | ENST00000414021 | 291 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000550.2-201 | ENST00000417463 | 774 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP24-201 | ENST00000420387 | 1106 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01427-201 | ENST00000420928 | 504 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160272.1-201 | ENST00000421509 | 521 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | GS1-594A7.3-201 | ENST00000421585 | 574 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AP000552.3-201 | ENST00000434730 | 775 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTND4P6-201 | ENST00000438297 | 472 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL589935.1-212 | ENST00000450998 | 525 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL157373.1-201 | ENST00000456036 | 276 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SYPL1P1-201 | ENST00000473622 | 768 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | SCOC-205 | ENST00000502535 | 679 nt | APPRIS ALT1 TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HTN1-204 | ENST00000511674 | 623 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MTCYBP43-201 | ENST00000513621 | 740 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | HSPA8P13-201 | ENST00000523715 | 472 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AKIRIN1P1-201 | ENST00000547384 | 544 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC010196.1-201 | ENST00000550014 | 450 nt | TSL 5 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC01481-201 | ENST00000552998 | 629 nt | TSL 2 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AL160237.1-201 | ENST00000554526 | 572 nt | TSL 4 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | LINC02345-201 | ENST00000557883 | 766 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | CYCSP39-201 | ENST00000565821 | 309 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | ZNF192P1-203 | ENST00000565888 | 810 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC037487.4-201 | ENST00000577423 | 625 nt | TSL 3 BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC006270.2-201 | ENST00000578523 | 652 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | MAGOH2P-202 | ENST00000584384 | 429 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC040904.1-201 | ENST00000590850 | 223 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | TEX41-222 | ENST00000597173 | 1134 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC099778.2-201 | ENST00000610904 | 211 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |
| RUNX3 | Q13761 | AC025588.4-201 | ENST00000615802 | 908 nt | BASIC | 3.01 | □□□□□ -1.93 | | |