Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL133271.1-201ENST00000538229 291 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC006349.1-201ENST00000555526 235 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CEP112-204ENST00000537949 2847 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PTK2-212ENST00000519419 4439 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC02302-201ENST00000556405 2904 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MYO3A-203ENST00000376302 2723 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL157777.2-201ENST00000258070 137 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL020994.2-201ENST00000413244 571 ntTSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC009965.2-201ENST00000425328 970 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL022396.1-201ENST00000427011 386 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC012070.1-201ENST00000442062 427 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC142086.4-201ENST00000568904 650 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 HDAC9-204ENST00000406451 9705 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 WEE2-201ENST00000397541 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RN7SKP125-201ENST00000410481 302 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
FOXE3Q13461 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.5 ms