Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AP003400.1-201ENST00000528319 231 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC090023.2-201ENST00000540875 545 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 SERPINA7-202ENST00000372563 1600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6-1032P-201ENST00000384100 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CTSL3P-202ENST00000412179 788 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 PTMAP3-201ENST00000447474 330 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RPL12P25-201ENST00000455592 494 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 TPPP2-202ENST00000460647 568 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC106782.4-201ENST00000568264 210 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 uc_338.18-201ENST00000615451 175 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 RUVBL2-213ENST00000639391 120 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 MATR3-228ENST00000620916 3134 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
AP3B2Q13367 ERGIC2-212ENST00000611644 4961 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PUS7L-201ENST00000344862 13593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 MAPK10-286ENST00000641208 8747 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 CEP97-201ENST00000341893 8361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL592291.1-201ENST00000403830 352 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 ARHGAP26-IT1-201ENST00000433186 388 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 DEFB108D-201ENST00000527787 222 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 PRR4-206ENST00000540107 388 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SL52P-201ENST00000584271 284 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 RN7SL435P-201ENST00000584418 282 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
AP3B2Q13367 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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