Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MTRNR2L5-201ENST00000512524 739 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
GRIN2BQ13224 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNU6-452P-201ENST00000384406 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 BNIP3P2-201ENST00000441221 577 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AL513343.1-201ENST00000451818 792 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 PIK3C2G-203ENST00000535651 2497 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RPL21P104-201ENST00000464143 478 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 HMGB1P47-201ENST00000511281 589 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MS4A1-205ENST00000528313 928 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
GRIN2BQ13224 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.8 ms