Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC008883.2-201ENST00000505796 414 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 OR5BM1P-201ENST00000512021 366 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 OR56A5-202ENST00000532411 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC020914.6-201ENST00000594327 272 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC022145.1-201ENST00000600673 383 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL512658.1-202ENST00000433486 400 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL360169.1-201ENST00000435116 143 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC126121.2-201ENST00000486137 698 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC110760.3-202ENST00000515177 371 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC099811.4-201ENST00000592536 496 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC009487.2-201ENST00000420969 6821 ntBASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 NFIB-202ENST00000380924 840 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL354754.1-201ENST00000449730 625 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
CBX3Q13185 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
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