Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC087650.1-201ENST00000431445 468 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MTND4LP18-201ENST00000526864 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC006960.3-201ENST00000561845 705 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC01002-215ENST00000632203 314 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 UBE2Q2P12-201ENST00000414573 204 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL031429.1-201ENST00000426775 749 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC00392-201ENST00000430033 557 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC118469.1-201ENST00000442943 488 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.49□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC3.49□□□□□ -1.85
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