Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 AC025588.2-201ENST00000604851 466 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 ACYP2-208ENST00000606865 674 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 AL161637.1-201ENST00000622380 412 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
BNIP1Q12981 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 FO393408.1-201ENST00000458577 582 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 KRTAP15-1-201ENST00000334067 671 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNU6-744P-201ENST00000365557 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 FAT1P1-201ENST00000406588 507 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC112673.1-201ENST00000513168 575 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AP002428.1-201ENST00000527345 380 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC026474.1-201ENST00000562422 428 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AP002782.1-201ENST00000623107 614 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
BNIP1Q12981 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms