Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 KRTAP21-3-201ENST00000444335 253 ntAPPRIS P1 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC010350.1-201ENST00000504908 231 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC010761.5-201ENST00000579468 287 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC100812.1-201ENST00000607622 580 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 MIR6719-201ENST00000622428 87 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 WDR75-207ENST00000631047 270 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 AC004803.1-201ENST00000503602 3207 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.66
CHRNEQ04844 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SPTLC1P2-201ENST00000407089 121 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL21P24-201ENST00000413752 448 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS15AP40-201ENST00000419621 391 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC024909.1-201ENST00000549278 599 ntTSL 4 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC123786.2-201ENST00000603459 275 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CNGA1-209ENST00000544810 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SMAD4-202ENST00000398417 8495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RDH10-AS1-201ENST00000514599 3261 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 VCAM1-203ENST00000370115 2475 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 AC068483.1-201ENST00000413403 660 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
CHRNEQ04844 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 144.4 ms