Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RNU2-28P-201ENST00000410457 189 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC004014.1-201ENST00000413406 538 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 SUMO1P4-201ENST00000429430 302 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AL353718.1-201ENST00000451028 517 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 PDCD10-207ENST00000471885 764 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 CDC42P4-201ENST00000510507 563 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AP001646.1-201ENST00000527936 915 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC090502.2-201ENST00000549267 280 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 HSFY1P1-202ENST00000425038 1381 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AL589826.1-201ENST00000340697 249 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 Z93403.1-202ENST00000440002 713 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AL500527.1-201ENST00000448532 255 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 MIR5007-201ENST00000583098 95 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
TTPAP49638 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
TTPAP49638 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.2 ms