Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 TRIM60P5Y-201ENST00000413946 574 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 TATDN1P1-201ENST00000414123 891 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTND1P33-201ENST00000446251 917 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC074051.3-201ENST00000570238 358 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 KBTBD2-208ENST00000621876 1196 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LIPI-204ENST00000614229 1439 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC1.99□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 ENSAP3-201ENST00000312710 333 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU6ATAC9P-201ENST00000516210 116 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC007275.1-201ENST00000621243 671 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL118520.1-201ENST00000450770 291 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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PTPRBP23467 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC113368.1-201ENST00000603736 382 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 CDKN2B-AS_3.1-201ENST00000617587 144 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
PTPRBP23467 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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