Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 LINC02293-202ENST00000548385 358 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 TMED3-202ENST00000424155 16555 ntTSL 3 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC009962.1-201ENST00000567327 3813 ntBASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.52□□□□□ -1.21
VGFO15240 RBM5-214ENST00000469838 2716 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 SLC12A6-216ENST00000560164 3744 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 ZNF506-201ENST00000443905 4095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNU6-682P-201ENST00000363843 106 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AL592431.1-201ENST00000451090 317 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AL353152.1-201ENST00000455973 470 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC006065.3-201ENST00000541769 419 ntTSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC005951.2-201ENST00000576282 495 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 EDA2R-203ENST00000396050 3429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 AHNAK2-201ENST00000333244 18254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.51□□□□□ -1.21
VGFO15240 C3orf67-209ENST00000482387 2617 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 PCA3-201ENST00000412654 3922 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 PHC3-214ENST00000494943 5030 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 CYB5AP4-201ENST00000396692 399 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 MTERF4-204ENST00000406593 802 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC026316.2-201ENST00000473110 263 ntTSL 3 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNU6-861P-201ENST00000516745 106 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 LINC02284-202ENST00000560924 566 ntTSL 4 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 SLFN12L-205ENST00000628453 1767 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC7.5□□□□□ -1.21
VGFO15240 CYLD-201ENST00000311559 5371 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 RASGRP1-209ENST00000559830 1910 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 CACNA1E-204ENST00000367567 14757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 RNVU1-6-201ENST00000364688 164 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 C1orf54-202ENST00000369099 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 DPYD-AS1-201ENST00000422980 533 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 CYP4F62P-203ENST00000455215 552 ntTSL 4 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 AL358913.1-201ENST00000554342 121 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 AC091045.1-201ENST00000561460 2277 ntTSL 5 BASIC7.49□□□□□ -1.21
VGFO15240 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.49□□□□□ -1.21
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