Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

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Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RPS24P8-201ENST00000431490 402 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC022150.3-201ENST00000599143 880 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC098617.1-203ENST00000609865 277 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 SDC2-204ENST00000519914 1318 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 IL6ST-212ENST00000522633 1878 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 HACD4-202ENST00000495827 8267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 DSCR8-201ENST00000357704 552 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 DSCR8-202ENST00000400477 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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RFXAPO00287 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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RFXAPO00287 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
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RFXAPO00287 DUSP12P1-201ENST00000612874 516 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
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RFXAPO00287 HMBOX1-202ENST00000355231 1694 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 ATP8B4-211ENST00000559829 4894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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RFXAPO00287 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 GTDC1-202ENST00000344850 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 LTN1-202ENST00000389194 7749 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 AC245100.2-201ENST00000454544 1679 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 GABRA3-201ENST00000370314 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
RFXAPO00287 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
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