Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC093106.2-201ENST00000428212 385 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPL12P39-201ENST00000455456 496 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RN7SL738P-201ENST00000470264 297 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC074133.1-201ENST00000515696 183 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC122688.1-201ENST00000541494 223 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AGBL1-AS1-203ENST00000566878 865 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ST8SIA4-201ENST00000231461 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 IPCEF1-202ENST00000367220 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RFX3-212ENST00000617270 9253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RYR3-208ENST00000622037 15564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MAPK10-328ENST00000641553 4009 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SELENOI-205ENST00000613142 8126 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC114774.1-201ENST00000507410 1770 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZNF638-201ENST00000264447 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PAK3-205ENST00000417227 2196 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 KSR2-201ENST00000339824 17726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RPL17P36-201ENST00000420302 549 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
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SOBPA7XYQ1 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC069307.1-201ENST00000602820 447 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL603840.1-201ENST00000422374 4063 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 CAV1-205ENST00000405348 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ANK3-201ENST00000280772 16874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 LINC00906-206ENST00000589921 3444 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 USP45-204ENST00000369233 2514 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZC3H14-201ENST00000251038 18281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZPLD1-202ENST00000466937 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 ZNF615-213ENST00000602063 4094 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 U8.4-201ENST00000363626 134 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.586-201ENST00000391146 98 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
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