Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RORB-201ENST00000376896 9551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF311-203ENST00000377179 2730 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 KLHL4-201ENST00000373114 2445 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 OPRM1-219ENST00000522555 2440 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MIR323A-201ENST00000362199 86 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AK6P2-201ENST00000549020 471 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RAPH1-209ENST00000439222 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC010401.2-201ENST00000575137 4934 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 UGT2A1-205ENST00000512704 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 EPHA4-202ENST00000409854 3454 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 PSD3-204ENST00000440756 11690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC007114.2-201ENST00000576014 4281 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 NRCAM-202ENST00000379022 3900 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 FBXO9-201ENST00000244426 4559 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LRRC37A3-202ENST00000334962 2654 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MIR3681HG-202ENST00000412606 578 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 CFL1P1-202ENST00000432948 411 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 PPIAP13-201ENST00000434706 478 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 USP12-AS1-201ENST00000440657 268 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC01496-201ENST00000448761 460 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RN7SL547P-201ENST00000490793 290 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SSX6-203ENST00000509958 336 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC000374.1-201ENST00000434698 1745 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AASDH-210ENST00000602986 3480 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MEF2C-249ENST00000637481 6088 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 NALCN-201ENST00000251127 6818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 OR3A3-203ENST00000641141 3800 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 OR2AG1-202ENST00000641258 6993 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 NLN-202ENST00000502464 8354 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 SNORA51.1-201ENST00000363243 140 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RN7SKP160-201ENST00000363804 340 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC018793.4-201ENST00000524542 585 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC133555.2-201ENST00000550213 292 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 LINC00933-205ENST00000560917 449 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MRPS21P9-201ENST00000571150 257 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 MIR6768-201ENST00000610734 72 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
TRIM35Q9UPQ4 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
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