Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
SAMD8Q96LT4 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU6-223P-201ENST00000362830 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU6-754P-201ENST00000391166 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL135752.1-201ENST00000479477 471 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010608.3-201ENST00000625048 527 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AP000776.1-201ENST00000530032 1663 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LINC01953-201ENST00000426870 717 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 PTENP1-201ENST00000447117 1215 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC010273.1-201ENST00000504129 946 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC087463.3-201ENST00000570105 415 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC103858.1-201ENST00000607019 476 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU6-270P-201ENST00000364131 105 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 DSTNP2-201ENST00000504533 515 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 AC106052.1-201ENST00000608029 497 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
SAMD8Q96LT4 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89 ms