Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 NPVF-201ENST00000222674 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 Z98749.1-201ENST00000454123 541 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL445669.2-201ENST00000454425 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 HTN1-204ENST00000511674 623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL133507.1-201ENST00000605269 557 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 XKR3-201ENST00000331428 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 KIAA1107-202ENST00000636278 4065 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC097714.1-201ENST00000511272 1647 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNU6-821P-201ENST00000390995 107 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RPL7P30-201ENST00000420888 709 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC104685.1-201ENST00000502445 371 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNA5SP380-201ENST00000517190 98 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 PLCE1P1-201ENST00000622094 305 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ZNF280D-201ENST00000267807 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
KNOP1Q1ED39 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.19□□□□□ -1.9
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