Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ACSL5-204ENST00000393081 3380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SAMMSON-226ENST00000642089 1582 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 KIAA0895-209ENST00000453212 956 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 NDUFB5P1-201ENST00000508134 564 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SNORA70.11-201ENST00000515987 138 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 SNORA70.13-201ENST00000516116 138 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNA5SP249-201ENST00000516127 99 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC244502.1-203ENST00000541008 576 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 OR1F2P-201ENST00000570470 933 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
RTN1Q16799 ZKSCAN8-201ENST00000330236 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ABCC9-204ENST00000538350 2672 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 C6-202ENST00000337836 3551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 FBXO38-218ENST00000513826 3585 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 HUWE1-214ENST00000612484 14311 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC104118.1-201ENST00000607625 1589 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.64□□□□□ -1.51
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RTN1Q16799 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AURKAPS2-201ENST00000454983 333 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 POU2F1-202ENST00000367862 14038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC006484.1-201ENST00000435086 1884 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC093775.1-201ENST00000624154 1868 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SLCO1B7-201ENST00000421593 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC5.64□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 GYS2-201ENST00000261195 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 DST-202ENST00000312431 17756 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC5.63□□□□□ -1.51
RTN1Q16799 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC5.63□□□□□ -1.51
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