Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 GAS5-223ENST00000452197 483 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC024558.1-201ENST00000505008 528 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MED28P6-201ENST00000558776 231 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AP001496.1-201ENST00000579113 471 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FXNQ16595 GPBP1-204ENST00000506184 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 CYLD-212ENST00000568704 3292 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 TM4SF1-202ENST00000472441 3115 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC020593.1-201ENST00000507399 299 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC008641.1-201ENST00000523781 248 ntTSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
FXNQ16595 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 GNRH1-202ENST00000421054 470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC091685.1-201ENST00000442436 448 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
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FXNQ16595 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
FXNQ16595 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
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