Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AL731563.2-201ENST00000431293 291 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC019226.1-201ENST00000625666 515 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 LINC01753-201ENST00000458145 631 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC114967.1-201ENST00000504890 259 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 LINC02101-201ENST00000505861 725 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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DDB1Q16531 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
DDB1Q16531 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
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