Protein–RNA interactions for Protein: Q16473

TNXA, Putative tenascin-XA, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNXAQ16473 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 GMFB-208ENST00000554908 6721 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TNXAQ16473 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC004485.1-201ENST00000439839 527 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC009961.3-201ENST00000449832 765 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MTCO3P11-201ENST00000455103 774 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 snoU13.22-201ENST00000459428 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 CAB39P1-201ENST00000502277 460 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ATP5F1P5-201ENST00000526403 760 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC079917.1-201ENST00000527828 584 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC079917.1-202ENST00000534059 625 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TNXAQ16473 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
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TNXAQ16473 PCNP-208ENST00000627393 136 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
TNXAQ16473 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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TNXAQ16473 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC010547.2-201ENST00000568523 409 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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TNXAQ16473 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
TNXAQ16473 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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