Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.43□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL049555.1-201ENST00000562834 1933 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 VSNL1-203ENST00000406397 2725 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LCMT1-AS2-202ENST00000565214 5666 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 EIF3H-209ENST00000521861 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-1127P-201ENST00000384580 107 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 U3.30-201ENST00000391308 210 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 VTI1BP4-201ENST00000427516 527 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 NOTCH2P1-201ENST00000443481 624 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 KRTAP5-14P-201ENST00000502328 121 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 MAK-203ENST00000474039 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 KMT2D-201ENST00000301067 19419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SLC15A2-201ENST00000295605 2379 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC5.42□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 PSG1-201ENST00000244296 2276 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 LRRC19-201ENST00000380055 3609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 NSD1-204ENST00000439151 12892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 BANF2-202ENST00000377805 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 CACYBP-203ENST00000406752 243 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RPL12P34-201ENST00000424532 479 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 RAB9BP1-201ENST00000519581 626 ntBASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC5.41□□□□□ -1.54
GRIK4Q16099 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC5.41□□□□□ -1.54
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