Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 STPG2-AS1-201ENST00000508933 537 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC055720.1-201ENST00000539552 475 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC010653.1-201ENST00000571108 881 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CEP83-202ENST00000397807 2737 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 EEF1A1-211ENST00000615060 3508 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 EIF4E3-202ENST00000389826 6083 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 LINC02431-201ENST00000503929 3601 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC006517.1-201ENST00000480485 328 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SNORA18.6-201ENST00000516792 115 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP004242.1-201ENST00000533701 349 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL157700.1-201ENST00000561973 1432 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RRAS2-202ENST00000414023 1884 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 MIR195-201ENST00000385194 87 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
VPS72Q15906 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.8 ms