Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL138775.1-201ENST00000429539 575 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC02532-205ENST00000430094 628 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 NHS-AS1-201ENST00000452788 366 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
USF2Q15853 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL353691.1-201ENST00000451332 387 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC080100.1-201ENST00000624239 5356 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
USF2Q15853 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 PRKG1-AS1-202ENST00000426785 1111 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC005297.2-201ENST00000450430 606 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 PRELID3BP6-201ENST00000503839 571 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SCARNA15.2-201ENST00000516409 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 SNORA31.22-201ENST00000517204 135 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC022039.1-201ENST00000527110 488 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC096558.2-201ENST00000546678 506 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
USF2Q15853 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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