Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 OR1M4P-201ENST00000589199 287 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC068631.1-220ENST00000630726 256 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNU4-72P-201ENST00000410754 173 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MORF4L1P7-201ENST00000426038 703 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 GTF2IP9-201ENST00000502460 301 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SATB1-AS1-266ENST00000630271 813 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC215522.3-201ENST00000635602 354 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 ZNF382-210ENST00000639288 834 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 ZNF732-202ENST00000619749 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 ZBTB8OS-202ENST00000373501 598 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 IPO7P1-201ENST00000442031 636 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL031659.1-201ENST00000447075 539 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AP004372.1-201ENST00000604842 844 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 ARL5AP3-201ENST00000439327 386 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 TRAV24-201ENST00000390453 343 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 U8.13-201ENST00000390842 128 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
ALX1Q15699 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158.8 ms