Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SNORA31.18-201ENST00000517043 134 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC159540.2-206ENST00000619371 355 ntTSL 3 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 PCDH9-AS2-201ENST00000419371 538 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LINC01611-203ENST00000454981 504 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SCARNA16.3-201ENST00000516595 184 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MIR3616-201ENST00000584070 92 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC079791.1-201ENST00000605356 973 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RNU6-889P-201ENST00000517189 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AP002826.1-201ENST00000608835 315 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL358075.3-201ENST00000426289 226 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 SATB1-AS1-204ENST00000453361 726 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 HMGB1P46-201ENST00000520062 610 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
TAF1AQ15573 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms