Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 DCN-218ENST00000551354 2924 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 AC005725.1-201ENST00000577346 2607 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 RAB30-212ENST00000533486 9929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TBC1D23-202ENST00000394144 3677 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 LDAH-212ENST00000619656 3663 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 CLCN3-201ENST00000347613 3635 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 TEX9-203ENST00000558083 4440 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
SKIV2LQ15477 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PCGF5-205ENST00000614189 7037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 GTDC1-207ENST00000409298 2209 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TNP2-201ENST00000312693 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 snoU13.20-201ENST00000459180 104 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RN7SL346P-201ENST00000491561 294 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC01598-206ENST00000513381 499 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC009852.2-201ENST00000567898 485 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CPDP1-201ENST00000579660 283 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PLEKHS1-205ENST00000369312 3443 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CRISP1-204ENST00000507853 1793 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RALGAPB-202ENST00000397040 8435 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SRPK2-201ENST00000357311 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LNPK-212ENST00000544803 7647 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC007098.1-201ENST00000420122 367 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL663074.2-201ENST00000440621 479 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC093815.1-201ENST00000508637 280 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 LINC02441-201ENST00000543651 552 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MAGI2-205ENST00000519748 3316 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF208-201ENST00000397126 3992 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 PTPRO-204ENST00000445537 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
SKIV2LQ15477 MCF2L2-202ENST00000414362 3031 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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