Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 VPS8-228ENST00000628962 207 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 UBE2V1P2-201ENST00000397758 440 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL356057.2-201ENST00000403318 432 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL590139.1-201ENST00000416267 400 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC011753.3-201ENST00000443436 406 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 PTRH2-203ENST00000470557 4114 ntAPPRIS P3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC006499.6-201ENST00000511169 607 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-390P-201ENST00000516259 103 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC010680.4-201ENST00000605334 543 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL157396.1-201ENST00000630034 8444 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 CASC1-202ENST00000354189 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MGA-202ENST00000545763 11413 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL583835.1-201ENST00000399570 407 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RPS16P5-201ENST00000406501 404 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 COX6B1P1-201ENST00000415962 213 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RPL23AP93-201ENST00000440847 484 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Z99127.1-202ENST00000448686 526 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC010631.1-201ENST00000474150 156 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC008745.1-201ENST00000604064 271 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC110801.1-201ENST00000623590 212 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 AC007405.1-203ENST00000623667 932 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
NCAPHQ15003 GRIK2-204ENST00000369137 4272 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.2 ms