Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU1-109P-201ENST00000383960 147 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MTCYBP45-201ENST00000435243 565 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC012055.2-201ENST00000504167 335 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL390208.1-201ENST00000605885 644 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TRGVB-201ENST00000453257 471 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MIR3912-201ENST00000577566 105 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL158013.1-202ENST00000419666 520 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 TMEM212-IT1-201ENST00000456146 470 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 RNU6-1028P-201ENST00000517164 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 MRPL42-204ENST00000548545 692 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AC069304.2-201ENST00000605154 435 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
DDX39BQ13838 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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