Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 ISCA1P2-201ENST00000438679 421 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC103798.1-201ENST00000532562 376 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 GTF2IP22-201ENST00000554443 182 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 UBE2L4-201ENST00000587688 464 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AC006927.3-201ENST00000638789 384 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CUL3Q13618 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 TFEC-203ENST00000393485 2704 ntTSL 2 BASIC3.34□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RAB9AP3-201ENST00000412737 573 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 LINC01412-201ENST00000413525 362 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 EDNRB-AS1-201ENST00000422405 601 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RAB9AP1-201ENST00000449393 573 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL390730.1-201ENST00000457106 692 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 UBA6-AS1-204ENST00000502758 547 ntTSL 4 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC027514.2-201ENST00000591014 637 ntTSL 3 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC007494.3-201ENST00000624660 743 ntBASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 RNU6-501P-201ENST00000364072 100 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL359837.1-201ENST00000381357 287 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 TRAJ17-201ENST00000390520 63 ntAPPRIS P1 BASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
CUL3Q13618 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.32□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.3 ms