Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC140479.6-201ENST00000633535 357 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PTCD2-202ENST00000380639 11151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 FGD4-210ENST00000525053 2925 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RASA1-203ENST00000506290 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RAB23-201ENST00000317483 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.333-201ENST00000365274 102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-1226P-201ENST00000384317 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC007389.2-201ENST00000434630 306 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC027613.1-201ENST00000508414 457 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZCCHC10-206ENST00000509008 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC026771.1-201ENST00000564672 415 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP1G1-207ENST00000564155 2723 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 POF1B-201ENST00000262753 3941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZNF468-203ENST00000595646 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC108210.1-201ENST00000510772 825 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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