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| PTK7 | Q13308 | SNORD5.1-201 | ENST00000458800 | 75 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC139718.1-201 | ENST00000508010 | 300 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-699P-201 | ENST00000517081 | 110 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-794P-201 | ENST00000517261 | 64 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | TMCO5B-203 | ENST00000529623 | 509 nt | TSL 4 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC138360.1-201 | ENST00000552332 | 386 nt | TSL 3 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC087500.2-201 | ENST00000575056 | 498 nt | TSL 5 BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ZNF181-203 | ENST00000459757 | 2265 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC104118.1-201 | ENST00000607625 | 1589 nt | BASIC | 5.7 | □□□□□ -1.5 | | |
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| PTK7 | Q13308 | ARHGEF3-203 | ENST00000413728 | 3992 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
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| PTK7 | Q13308 | C3orf67-AS1-202 | ENST00000482372 | 2203 nt | TSL 2 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.2-201 | ENST00000362330 | 96 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC087884.1-201 | ENST00000469738 | 328 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC084198.1-201 | ENST00000477747 | 402 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AC026979.1-201 | ENST00000492525 | 396 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC116655.1-201 | ENST00000508324 | 901 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | GMPSP1-201 | ENST00000514075 | 579 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU4ATAC18P-201 | ENST00000516179 | 126 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RRM2B-207 | ENST00000519962 | 201 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC100871.2-201 | ENST00000522005 | 327 nt | TSL 3 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC015813.2-201 | ENST00000578794 | 711 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL52P-201 | ENST00000584271 | 284 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC02112-205 | ENST00000606744 | 236 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL161423.1-201 | ENST00000613700 | 262 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL722P-201 | ENST00000617780 | 284 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RN7SL565P-201 | ENST00000618246 | 284 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL732372.2-225 | ENST00000642124 | 456 nt | BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RAB30-212 | ENST00000533486 | 9929 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | FNIP1-201 | ENST00000307954 | 6366 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.69 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC016705.1-201 | ENST00000548231 | 1891 nt | TSL 5 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZFX-211 | ENST00000539115 | 6801 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | CDH19-201 | ENST00000262150 | 6341 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | SOX5-216 | ENST00000546136 | 6975 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | PIAS2-204 | ENST00000585916 | 11075 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-115P-201 | ENST00000365329 | 160 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1318P-201 | ENST00000365389 | 103 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.473-201 | ENST00000384333 | 102 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-14P-201 | ENST00000384630 | 106 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
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| PTK7 | Q13308 | RNU6-907P-201 | ENST00000390924 | 102 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC112721.2-201 | ENST00000409910 | 541 nt | TSL 4 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC093151.1-201 | ENST00000427711 | 313 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | NRBF2P3-201 | ENST00000432731 | 865 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | NDUFB4P8-201 | ENST00000435351 | 367 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC078993.1-203 | ENST00000435789 | 1037 nt | TSL 5 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL138916.1-201 | ENST00000436295 | 455 nt | TSL 3 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | CEACAMP6-201 | ENST00000452007 | 574 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-138P-201 | ENST00000459479 | 64 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AP000942.1-201 | ENST00000463969 | 747 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | BCL2L15-204 | ENST00000471267 | 267 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC012158.1-204 | ENST00000483430 | 465 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | MTND4LP22-201 | ENST00000508209 | 276 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINC01256-201 | ENST00000513270 | 508 nt | TSL 2 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC127894.1-201 | ENST00000548266 | 851 nt | TSL 3 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC073539.2-201 | ENST00000597113 | 165 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | BDH2P1-201 | ENST00000602288 | 736 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL161616.1-201 | ENST00000611867 | 286 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | Metazoa_SRP.93-201 | ENST00000622525 | 276 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | GTDC1-206 | ENST00000409214 | 2954 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | PCDH15-215 | ENST00000409834 | 5401 nt | TSL 5 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | ACE2-201 | ENST00000252519 | 3393 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | SPATA5-201 | ENST00000274008 | 8137 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | LINGO2-201 | ENST00000308675 | 3031 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC093591.2-201 | ENST00000565254 | 3843 nt | BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | SCN2A-207 | ENST00000631182 | 8430 nt | APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |
| PTK7 | Q13308 | ING3-205 | ENST00000445699 | 1723 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.68 | □□□□□ -1.5 | | |