Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC073476.4-201ENST00000628409 72 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 AC010680.1-201ENST00000590024 3590 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SRSF5Q13243 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 KERA-201ENST00000266719 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC044781.1-201ENST00000446193 570 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MTCYBP11-201ENST00000447254 1109 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC004009.2-201ENST00000623016 728 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL157770.1-201ENST00000623049 439 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 ZNF567-201ENST00000360729 2691 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 OFD1P1Y-201ENST00000411756 1225 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 UBL5P3-201ENST00000475112 231 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNU6-798P-201ENST00000516912 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC125611.1-201ENST00000549563 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SRSF5Q13243 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82 ms