Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
NME3Q13232 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNA5SP310-201ENST00000459084 116 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL30P9-201ENST00000465586 330 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 OR5G4P-201ENST00000525251 760 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP003718.1-201ENST00000529884 583 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MAPK10-362ENST00000641864 4484 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 HDX-206ENST00000506585 6158 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC01445-202ENST00000458615 679 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC025465.2-201ENST00000502809 608 ntTSL 2 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 GLIPR1L1-204ENST00000548623 484 ntTSL 3 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
NME3Q13232 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC233728.2-201ENST00000425348 757 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 UBE2E2-AS1-202ENST00000430018 499 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 FAM172BP-201ENST00000487497 1089 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 LINC02484-201ENST00000513843 546 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
NME3Q13232 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.3 ms