Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL355472.4-201ENST00000610233 626 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LRRC49-224ENST00000560691 2531 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU6-920P-201ENST00000410926 92 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC017074.1-201ENST00000424612 561 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC011742.1-201ENST00000431448 434 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SETD6P1-201ENST00000444575 317 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL158210.1-201ENST00000448835 500 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AP001458.1-201ENST00000532626 92 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MEG8-215ENST00000555354 469 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MAFTRR-204ENST00000568389 506 ntTSL 4 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC010547.3-201ENST00000569271 440 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC012409.2-201ENST00000619812 751 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CHM-205ENST00000615443 2821 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 UACA-202ENST00000379983 4859 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU5F-6P-201ENST00000362979 116 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC092155.1-202ENST00000416111 932 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
CHAF1BQ13112 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
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