Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 GABRG2-222ENST00000639975 3662 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RAC1P7-201ENST00000445367 377 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC02384-205ENST00000539404 785 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 DOCK7-204ENST00000454575 6985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC002456.1-203ENST00000412669 449 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC018495.1-201ENST00000440266 452 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC026784.1-201ENST00000507986 352 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC011611.1-201ENST00000552179 197 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ZNF266-204ENST00000590306 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 Z93403.1-201ENST00000411879 895 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 VN1R104P-201ENST00000505115 1009 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 IGKV2-23-201ENST00000518729 323 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC009435.1-201ENST00000519555 574 ntTSL 4 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AC025272.1-201ENST00000569661 483 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
CHAF1AQ13111 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
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