Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

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Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC004241.3-201ENST00000611728 517 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
PRDM2Q13029 PLSCR5-201ENST00000443512 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 SPINT4-201ENST00000279058 512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC093110.1-201ENST00000456363 602 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 TRIQK-207ENST00000519069 598 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MTND2P13-201ENST00000577438 1039 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 STX19-201ENST00000315099 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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PRDM2Q13029 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 NEBL-202ENST00000377122 9216 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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PRDM2Q13029 RNU6-347P-201ENST00000516658 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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PRDM2Q13029 AL031716.1-201ENST00000569106 530 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC093536.2-201ENST00000565257 1406 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
PRDM2Q13029 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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