Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RPS3AP12-201ENST00000443616 753 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC068724.1-201ENST00000487100 792 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RPL12P22-201ENST00000519073 490 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC093725.1-201ENST00000508135 2672 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 OR5B3-201ENST00000309403 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 U3.39-201ENST00000408569 239 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AL592447.1-201ENST00000447592 540 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 U3.44-201ENST00000458938 192 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 NARSP2-202ENST00000522022 349 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC087752.4-201ENST00000605911 462 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 OR5B3-202ENST00000641865 1046 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
GRIK3Q13003 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.7 ms