Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC027458.1-201ENST00000563639 613 ntTSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC099060.1-201ENST00000427806 448 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC109583.1-201ENST00000432156 268 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AL035411.2-201ENST00000604022 421 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RPL5P19-201ENST00000404228 893 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 GSAP-208ENST00000441833 737 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 C3orf49-203ENST00000616659 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MIR591-201ENST00000385290 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 DUXAP3-201ENST00000603616 594 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 PCF11-AS1-201ENST00000602322 1516 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RPL7P31-201ENST00000450192 724 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC067805.1-201ENST00000559344 470 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AP001029.2-202ENST00000588197 739 ntTSL 3 BASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
BPTFQ12830 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
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