Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 RNU4ATAC10P-201ENST00000516967 122 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC092953.2-201ENST00000608000 699 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC073968.1-201ENST00000618594 637 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AP003485.1-201ENST00000625093 753 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 COPS2-203ENST00000542928 1580 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SMARCB1Q12824 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 C1GALT1-202ENST00000402468 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL354994.1-201ENST00000445967 194 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RPS29P12-201ENST00000460178 152 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP002770.2-201ENST00000543613 532 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC011611.4-201ENST00000547721 779 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC138915.2-201ENST00000569776 97 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC090409.2-202ENST00000585706 604 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 VN1R83P-201ENST00000595685 445 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC091057.3-201ENST00000602684 733 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC00587-201ENST00000374801 590 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL031679.1-201ENST00000400616 525 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SEPT7P5-201ENST00000434048 306 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AL365204.2-201ENST00000446754 687 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC004022.1-201ENST00000447766 1066 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RN7SKP31-201ENST00000516354 278 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC024958.1-201ENST00000519364 902 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC010376.1-201ENST00000522101 334 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 MTND3P13-201ENST00000574391 343 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 RNASEH2B-AS1-202ENST00000593369 648 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SMARCB1Q12824 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms