Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 GTF2IP7-202ENST00000436677 309 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC090819.1-201ENST00000523800 1111 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 OR8B3-201ENST00000354597 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 OR8B2-201ENST00000375013 942 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC015771.1-201ENST00000527283 554 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC092747.1-202ENST00000540595 380 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC010511.1-202ENST00000590229 573 ntTSL 4 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 DHFRP5-201ENST00000406944 564 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL357375.1-201ENST00000424274 525 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RPL23AP7-203ENST00000449021 469 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SYNE2-210ENST00000553455 674 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MIR216A-201ENST00000385063 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RNU6-882P-201ENST00000391025 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AC114763.2-201ENST00000412593 826 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
CENPEQ02224 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.9 ms