Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC097478.4-201ENST00000615968 522 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC02475-202ENST00000512678 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNA5SP97-201ENST00000365006 84 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC091390.1-201ENST00000433904 331 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 NUTF2P7-201ENST00000453086 375 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC093853.1-201ENST00000515689 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-1220P-201ENST00000517126 108 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 SUB1P2-201ENST00000556401 297 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC023034.1-202ENST00000558153 684 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 TMEM212-205ENST00000619900 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CASC1-203ENST00000395987 2363 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 SNORA70.2-201ENST00000364506 135 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC018710.1-201ENST00000506509 158 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC024587.2-201ENST00000509458 805 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC005798.1-201ENST00000513715 387 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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PGGT1BP53609 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
PGGT1BP53609 AC015908.4-201ENST00000582334 575 ntTSL 4 BASIC3.69□□□□□ -1.82
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