Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 MIR99AHG-205ENST00000435697 716 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 RAB9AP2-201ENST00000443911 597 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AC090453.1-201ENST00000495560 436 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
PTPRMP28827 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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PTPRMP28827 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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PTPRMP28827 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
PTPRMP28827 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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