Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC5.4□□□□□ -1.54
USP35Q9P2H5 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZNF107-203ENST00000395391 6094 ntTSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.4□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ABCF2P2-201ENST00000450549 296 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RAP1BP2-201ENST00000478270 544 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC025254.1-201ENST00000550035 247 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC090371.2-202ENST00000582239 644 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 uc_338.12-201ENST00000616344 181 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC008725.1-201ENST00000605123 2263 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 DEFB109C-201ENST00000382575 264 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 DEFB109B-201ENST00000382656 264 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 DNAJC12-205ENST00000483798 769 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LINC00971-203ENST00000491849 452 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 APELA-204ENST00000515275 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC100870.1-201ENST00000522035 505 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 TRDJ1-201ENST00000390473 51 ntAPPRIS P1 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC093156.1-201ENST00000440382 670 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 RPL9P32-201ENST00000464118 620 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AP002075.1-201ENST00000505091 603 ntTSL 3 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP35Q9P2H5 AC025554.1-201ENST00000505641 188 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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